Jonathan Wilkinson est diplômé de la University of Saskatchewan en sciences politiques. Il détient également une maîtrise en politique, philosophie et économie de la Oxford University, une maîtrise en relations internationales de l’Université McGill et un certificat en gestion des affaires de la Ivey Business School. Il débute sa carrière en 1991 à titre de négociateur pour le gouvernement saskatchewanais pendant les consultations constitutionnelles de Charlottetown. En 1992, il est nommé conseiller spécial au premier ministre de la Saskatchewan, avant de travailler de 1993 à 1995 comme responsable des relations économiques intergouvernementales. En 1995, il fait le saut dans le secteur privé à titre de gérant chez Bain and Company, un poste qu’il occupe jusqu’en 1999. Cette année-là, il rejoint QuestAir Technology en tant que vice-président du développement des affaires. Il occupe des positions à responsabilités croissantes au sein de cette entreprise puisqu’en 2001 il est nommé président et chef de l’exploitation, puis président-directeur général de 2002 à 2008.
En 2009, M. Wilkinson se joint à Nexterra Systems Corp en tant que vice-président directeur du développement des affaires, un poste qu’il occupera pendant deux ans. De 2011 à 2014, il travaille à titre de président-directeur général de BioteQ Environnemental Technologies. En 2015, il se lance en politique sous la bannière du Parti libéral dans la circonscription de North Vancouver. Il est élu et nommé secrétaire parlementaire du ministre de l’Environnement et du Changement climatique. En 2018, il est désigné ministre des Pêches, des Océans et de la Garde côtière canadienne. Il est réélu lors des élections de 2019 et est alors nommé ministre de l’Environnement et du Changement climatique.