Au cours de sa carrière, Isabelle Hudon a occupé plusieurs postes en communication au sein de la fonction publique canadienne, notamment au ministère des Affaires étrangères et de l’Agence spatiale canadienne. Elle a également travaillé pour des entreprises telles que Bell et Bombardier.
En 2001, elle rejoint le comité de transition de la Ville de Montréal en tant que directrice des communications. L’année suivante, elle se joint à la Chambre de commerce du Montréal métropolitain à des postes à responsabilités croissantes avant d’accéder à la présidence en 2005. Elle prend la tête de l’entreprise Marketel en 2008 et est nommée, en 2010, présidente pour le Québec de la Financière Sun Life. En 2014, elle devient chef de la direction du Québec et vice-présidente principale de la division canadienne Solutions clients. C’est en 2017 qu’Isabelle Hudon est nommée ambassadrice du Canada en France.